Investigador Independiente de CONICET / Profesor Adjunto (DS) UNC
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Tema de Investigación
Biofísica de procesos biológicos asociados a la interacción de proteínas virales con membranas lipídicas y (bio)macromoléculas
Los virus con envoltura, como el caso del HIV, Influenza, Dengue, Zika, SARS-CoV, etc., son patógenos que representan un problema serio a nivel de enfermedades no solo humanas sino en plantas y animales. Más allá del organismo que afecten o la patología que produzcan, que varía en para cada virus, presentan en común una doble capa formada por una cápside proteica y una membrana lipídica denominada envoltura vírica. También, su gemación, que es la formación de partículas pre-virales, se produce en membranas específicas de las células infectadas. Por ejemplo, el virus de HIV posee una composición lipídica que es parte de la membrana plasmática de la célula huésped mientras que, por ejemplo, para los virus de Dengue y Zika esta envoltura proviene del retículo endoplásmico. El evento asociación de todas los componentes virales (genoma y proteínas) en estas interfases membrana-entorno celular está orquestado por proteínas matices que forman la cápside del virus. En general, estas proteínas son las que se asocian a la membrana de la célula para reclutar todos sus elementos e iniciar la producción de viriones. Conocer como estas proteínas se asocias a la membrana, a las proteínas y genoma viral y, en algunos casos, con otros componentes de las células infectadas, es fundamental para poder, no solo comprender los procesos biofísicos que involucran dichas interacciones, sino que también poder acceder a nuevos blancos terapéuticos para su tratamiento. El laboratorio se aboca a comprender los fenómenos fisicoquímicos de estos eventos basado en el estudio de proteínas matrices y/o cápsides virales con sistemas modelo de biomembranas.
Becarios Integrantes del Grupo
- Luis Benito Perez Socas. Becario de CONICET.
- Federico Guzmán. Becario doctoral FONCyT
Publicaciones Seleccionadas
- Dengue and Zika virus capsid proteins bind to membranes and self-assemble into liquid droplets with nucleic acids. Ambroggio EE, Costa Navarro GS, Pérez Socas LB, Bagatolli LA, Gamarnik AV. J Biol Chem. 2021 Sep;297(3):101059. doi: 10.1016/j.jbc.2021.101059. Epub 2021 Aug 8.
- The influence of myristoylation, liposome surface charge and nucleic acid interaction in the partition properties of HIV-1 Gag-N-terminal peptides to membranes. Pérez Socas LB, Ambroggio EE. Biochim Biophys Acta Biomembr. 2020 Nov 1;1862(11):183421. doi: 10.1016/j.bbamem.2020.183421. Epub 2020 Jul 22.
- Detecting phospholipase activity with the amphipathic lipid packing sensor motif of ArfGAP1. Quartino PY, Fidelio GD, Manneville JB, Goud B, Ambroggio EE. Biochem Biophys Res Commun. 2018 Oct 20;505(1):290-294. doi: 10.1016/j.bbrc.2018.09.116. Epub 2018 Sep 22. PMID: 30249399
- Myristoylation and Oligonucleotide Interaction Modulate Peptide and Protein Surface Properties: The Case of the HIV-1 Matrix Domain. Socas LBP, Ambroggio EE. Langmuir. 2018 May 29;34(21):6051-6062. doi: 10.1021/acs.langmuir.8b01005. Epub 2018 May 17. PMID: 29727193
- ArfGAP1 generates an Arf1 gradient on continuous lipid membranes displaying flat and curved regions. Ambroggio E, Sorre B, Bassereau P, Goud B, Manneville JB, Antonny B. EMBO J. 2010 Jan 20;29(2):292-303.
- Direct visualization of membrane leakage induced by the antibiotic peptides: maculatin, citropin, and aurein. Ambroggio EE, Separovic F, Bowie JH, Fidelio GD, Bagatolli LA. Biophys J. 2005 Sep;89(3):1874-81.
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Colaboraciones
- André Matagne-University of Liège
- Andrea Gamarnik-Instituto Leloir-Argentina
- Soledad Celej-CIQUIBIC-CONICET-Argentina
- Gerardo Fidelio-CIQUIBIC-CONICET-Argentina
- Laura Fanani-CIQUIBIC-CONICET-Argentina
- Luis Bagatolli-INIMEC-Argentina
- Mariana del Vas-INTA-Argentina
Breve Curriculum Vitae
Objetivos
Entender cómo aspectos físicos de membranas lipídicas modulan o controlan la asociación y actividad de proteínas.
Educación
- Especialista en ingeniería gerencial (2015)
- Dr. en Ciencias Químicas (2007)
- Licenciado en Ciencias Químicas (2001)
Posiciones pasadas
- Postdoc en el instituto Curie en el laboratorio del Dr. Bruno Goud (2007-2010)
- Postdoc en NIH en el laboratorio de la Dra. Jennifer Lippincott-Schwartz (2010-2011)
- Profesor invitado de la Universidad de Liège, en el laboratorio Dr. Matagene (2021-2022).
Experiencia Laboral
Técnica: Purificación de proteínas, cromatografía líquida, FTIR, Fluorescencia, Capas monomoleculares de Langmuir. Diseño de experimentos en sistemas high-throughput.
