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CIFUENTES SAMBONI, Ubeiden

Becario doctoral de CONICET/ Profesor Auxiliar UNC
Director: Guillermo Montich
E-Mail: ubeiden-samboni@unc.edu.ar

 

Tema de Tesis

Regulación de la Conformación y Funcionalidad de Proteínas de Membrana por el Ambiente Lipídico
Para llevar a cabo este trabajo de investigación hemos realizado experimentos de expresión de proteínas de membrana en bacterias E. coli, con posterior lisis por diferentes métodos, he utilizado métodos cromatográficos para la purificación como son exclusión molecular, afinidad a níquel – AKTA, y HPLC en fase reversa. Para la obtención de péptidos hemos realizados experimentos con enzimas de corte TEV, diálisis, estrategia de concentración de proteína-péptido y liofilización. Seguimiento de pureza por SDS-PAGE por coomassie blue y tinción con plata y espectrometria de masas. Para el análisis de interacción péptidos-membrana, hemos realizado preparación de vesículas multilamelares (MLV’s) en presencia y ausencia de péptidos y posterior analisis por microcalorimetría de barrido diferencial (DSC). También hemos realizado experimentos de monocapas de Langmuir de cada péptido transmembrana en diferente composición lipídica. A nivel in silico he realizado simulaciones de péptidos transmembrana en bicapas lipídicas usando el paquete de cálculo gromacs.

Breve Currículum Vitae
  •  Estudiante de doctorado en Ciencias Químicas Departamento de Química Biológica Ranwel Caputto, Facultad de Ciencias Químicas, Universidad Nacional de Córdoba (UNC), – Centro de Investigaciones en Química Biológica de Córdoba – CONICET.
  • Áreas de interés: Biofísica de proteínas Dinámica Molecular Química Computacional Teoría Funcional de la Densidad

Formación Académica

  • 2018–actual: Doctorado en Ciencias Químicas Título de tesis: Regulación de la Conformación y Funcionalidad de Proteínas de Membrana por el Ambiente Lipídico. Director: Dr. Guillermo Montich (gmontich@gmail.com)
  • Pregrado/Universitario 2011–2017: Químico (Qco) Título del trabajo de grado: Algunas Propiedades Estructurales, Electrónicas y Vibracionales del Óxido de Fosfina Difenil[2-(2-Piridilaminometil)-Fenil]. Un Estudio Químico Cuántico. Facultad de Ciencias Básicas y Tecnologías, Universidad del Quindío, Colombia. Director: Magister. Alberto Sánchez López (asanchezl@uniquindio.edu.co)

Formación Complementaria

Cursos de posgrado y/o capacitaciones extracurriculares

  • Noviembre 2021: Estructura y Dinámica de Proteínas. Universidad Nacional de Córdoba; 40 horas.
  • Noviembre 2020: Programación en Python. Universidad Nacional de San Martin, Argentina; 64 horas.
  • Octubre 2020: Análisis de Simulaciones de Dinámicas Moleculares. BioScience-App Courses, Centro de Biofísica Teórica Rice University; 10 horas
  • Septiembre 2020: Introduction to Data Science in Python; University of Michigan (Online-Coursera); 31 horas.

Experiencia Docente

Universitario/grado

  •  Marzo 2022–Julio 2022: Biofísico Química; Facultad de Ciencias Químicas, Universidad Nacional de Córdoba. Dedicación: 10 horas Semanales.
  • Agosto 2021–Diciembre 2021: Laboratorio IV-Química Biológica; Departamento de Química Biológica Ranwel Caputto, Facultad de Ciencias Químicas, Universidad Nacional de Córdoba. Dedicación: 10 horas Semanales.
  • Marzo 2021–Julio 2021: Biofísico Química; Facultad de Ciencias Químicas, Universidad Nacional de Córdoba. Dedicación: 10 horas Semanales.

Membrecías

  •  2020-actual: Jóvenes Biofísicos – The Young Initiative on Biophysics (YIB), Argentina
  • 2018-actual: Sociedad Argentina de Biofísica – SAB; Argentina

Asistencia a Reuniones Científicas

  • 2021: XLVIII Reunión Anual de la Sociedad Argentina de Biofísica: Virtual. Tipo de evento: Congreso. Ámbito: Nacional. Modo de participación: Asistente. Lugar: La Plata, Buenos Aires, Argentina.
  • 2018: XLVII Reunión Anual de la Sociedad Argentina de Biofísica. Tipo de evento: Congreso. Ámbito: Nacional. Modo de participación: Presentador de póster. Lugar: La Plata, Buenos Aires, Argentina.

Manejo de herramientas y habilidades

  • Expresión y purificación de proteínas-péptidos: técnicas de cromatografía (Afinidad iónica-AKTA, Exclusión Molecular, HPLC), SDS PAGE.
  • Espectroscopia: Fluorescencia, FT-IR, UV-vis. Calorimetría DSC.
  • Preparación de membranas sintéticas (MLV’s, LUV’s).
  • In silico: dinámica molecular de sistemas péptidos en bicapas. Cálculos a nivel cuántico de propiedades estructurales, electrónicos y vibracionales de moléculas orgánicas.
  • Uso básico de: Python, Excel, Linux, Gromacs, Gaussian 09, NBO 6.0